点击右上角微信好友

朋友圈

请使用浏览器分享功能进行分享

正在阅读:宏基因组测序技术:用对才能用好
首页> 科技频道> 综合新闻 > 正文

宏基因组测序技术:用对才能用好

来源:科技日报2021-05-13 15:17

调查问题加载中,请稍候。
若长时间无响应,请刷新本页面

  “回想2003年没有mNGS技术的时候,我们认识SARS冠状病毒需要5—6个月,而现在认知新冠病毒,国内科学家只用了很短时间。”5月8日,复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏教授在第三届感染性疾病精准医学高峰论坛上表示,认知新发病原体,新技术起到了重要的作用。

  “在国家传染病防治重大科技专项支持的平台基础上,基于二代测序的mNGS技术,中国医学科学院团队用了约50个小时就从不明原因肺炎样本中获得了新冠病毒全基因组序列,与其他兄弟单位共同确认新冠病毒是导致疫情的病原。”中国医学科学院北京协和医学院副院校长王健伟教授表示,新技术找到了新冠病毒,新冠疫情也促进了新技术的应用发展,未来应推进新技术在精准诊断、遏制耐药、防控新发病原等方面持续发力。

  mNGS究竟是啥?

  如何让识别新发病原体的速度好比坐上了飞机?

  普通人用上它了吗?

  它让感染治疗从“炮轰”到“狙击”

  “在没有新技术之前,如果遇到严重的感染中毒症,往往是各种抗感染的药物一起上。”张文宏说,因为传统技术时常给不出明确的感染病原信息。

  “炮轰”式的操作难有针对性,难以有效压住感染,反而容易导致细菌的耐药性。

  “炮轰”不行,能不能“狙击”?

  2014年6月,《新英格兰杂志》上的论文记载了一场成功的“狙击”——

  一例不明原因的脑膜炎,用尽各种治疗手段未果,但在使用mNGS后,明确了病原体为致病性钩端螺旋体,改用几毛钱成本的青霉素治疗,患者获救。

  这一战名声大噪。mNGS就是宏基因组测序技术,通过全面分析患者样本中微生物和遗传物质(包括DNA和RNA),识别“坏分子”,实现感染性疾病的精准治疗。

  “它无需事先了解预期的病原体,能够同时检测大量的微生物。”张文宏总结,mNGS拥有辨新、海量筛查病原体等多项优势。

  它的正确解读仍需“立规矩”

  “这个方法很灵敏,就更需要警惕会不会搞错。”王健伟指出,因为方法足够灵敏,很细小的过程偏差也会反映到输出的结果上,例如环境污染、生物信息分析偏差甚至软件算法等造成的差异,也会导致对单个碱基的解读完全不同。

  如何正确解读宏基因组测序所给出的证据,以指导临床实践,成为实现感染性疾病精准诊断的重点之一。

  “解读包括mNGS的临床规范、报告的理解等多个阶段的问题。”国家卫生健康委全国真菌病监测网国家中心主任、中国医学科学院北京协和医院检验科主任徐英春表示,规范的建立是为了把mNGS技术在临床上用好。

  据介绍,国家卫生健康委临床检验中心今年开展了首次mNGS技术室间质评,全国包括第三方实验室在内的约90家实验室参与,在面对复杂的鉴别考卷时,只有5家实验室获得满分。

  “从临床规范来讲,mNGS行业仍需要通过相关部门的引导来推进标准化和质量可控性,这一点对于临床非常重要。”在室间质评中获得满分的微远基因的创始人、首席执行官李永军表示,后续将通过技术创新实现医院实验室内mNGS设备的自动化,以增加检测效能,并满足标准化等要求。

  它现在普及了吗?

  10年前,一个宏基因组检测的成本约为十几万元左右,而今已经下降到数千元级别。随着成本大幅下降,宏基因组测序已逐步应用于重症患者的病原学诊断中。

  “目前,绝大多数医院未建立自有平台,而是借助第三方服务。从临床需求来看,医院自建实验室和第三方提供检测服务都在发展。”中华医学会重症分会副主任委员、中国医科大学附属第一医院重症医学科马晓春主任表示,从目前mNGS技术使用反馈结果来看,整体的质量把控和临床效果有利于患者诊疗。

  如何能让新技术为老百姓服务好、服务对?

  马晓春提醒,现在这一行业发展仍处于发展初期,提供服务的企业较多,应加紧制定系统化、规范化的标准,以利于市场整体的发展成熟和临床诊疗的正确实施。此外,该技术目前并未纳入医保,在后续技术、体系成熟的基础上,通过规划将其纳入整体医疗体系当中,才能使它更好地服务于人民生命健康。(张佳星)

[ 责编:蔡琳 ]
阅读剩余全文(

相关阅读

您此时的心情

光明云投
新闻表情排行 /
  • 开心
     
    0
  • 难过
     
    0
  • 点赞
     
    0
  • 飘过
     
    0

视觉焦点

  • 大陆海事部门在台湾海峡西侧水域开展联合巡航

  • 陕西清涧寨沟遗址

独家策划

推荐阅读
万兆元年,谁来领航?是更智慧AI,是更领先的Advance,是刷新极限的速度,还是升级多维的体验?中国移动5G-A商用发布会,重新定义数智新时代,邀您共同见证!3月28日15:00-16:00
2024-03-28 12:36
作为中国大科学装置之一,高能同步辐射光源是由中国科学院、北京市共建的怀柔科学城大科学装置集群的核心装置。
2024-03-28 09:54
2022年8月15日,国际天文学联合会小天体命名工作组发布公告,将国际永久编号为192353号的小行星命名为“王大中星”。围绕大学的根本任务是育才造士这一核心要义,王大中归纳并紧抓建设一流大学的三大要素:大师、大楼和大学精神。
2024-03-28 09:34
坎潘特强调,最新观测表明,精确的星震学技术可用于探测表面温度低至4200℃(比太阳表面低约1000℃)的矮星,为天体物理观测开辟了一个新领域。这一最新结果表明,星震学技术有望详细表征这些恒星及其宜居行星的细节,而精确确定附近冷矮星的年龄对于阐释系外行星上发现的生物特征可能至关重要。
2024-03-28 09:33
记者从自然资源部3月27日召开的例行新闻发布会上获悉:今年是极地考察40周年,自然资源部将开展一系列活动纪念这一重要时间节点。7月北极黄河站建站20周年时,在黄河站举办招待会、研讨会等相关活动,中国第四十一次南极考察期间将在长城站、中山站举行招待会、研讨会等相关活动,“雪龙”号、“雪龙2”号船停靠外港时举行公众开放日活动。
2024-03-28 09:32
联合国教科文组织执行局27日批准18处地质公园列入世界地质公园网络名录,其中包括中国的6个地质公园,分别是长白山世界地质公园、恩施大峡谷-腾龙洞世界地质公园、临夏世界地质公园、龙岩世界地质公园、武功山世界地质公园、兴义世界地质公园。
2024-03-28 09:31
据介绍,除了服务于中国探月工程四期,后续鹊桥二号中继星还可为国内外月球探测提供中继通信支持。
2024-03-28 09:25
涂白防虫、修剪树枝、引水灌溉……每当春天到来,在祖国西北边陲新疆托里县老风口,生态造林工作就紧锣密鼓地开始了。
2024-03-27 10:22
今年我国纪念“世界水日”“中国水周”的活动主题为“精打细算用好水资源,从严从细管好水资源”。
2024-03-27 10:21
在齐齐哈尔市甘南县宝山乡巨宏村,村民苑忠国正在准备春耕,多年来通过参与县里的培训,春耕物资的采购对他来说已是轻车熟路。
2024-03-27 10:20
在开展调查监测,评估新污染物环境风险状况方面,《行动方案》提出建立化学物质环境信息调查制度、建立新污染物环境调查监测制度、建立化学物质环境风险评估制度、动态发布重点管控新污染物清单等具体措施。
2024-03-27 10:18
一群“麦哲伦”式的实验物理学家正在高能物理的版图上开疆拓土。而玻色子的发现,正在指向新的“盛宴”。
2024-03-27 10:16
作为古生物学家,徐星是中国科学院院士、中国科学院古脊椎动物与古人类研究所研究员,同时也是云南大学教授,主要从事中生代陆相脊椎动物化石及地层学研究。
2024-03-27 10:15
近期,12P/Pons-Brooks彗星(以下简称12P彗星)成为全球瞩目的对象,我国不少天文爱好者成功观测并拍摄到这位“天外来客”。
2024-03-26 03:25
日前,中办、国办印发《关于加强生态环境分区管控的意见》(以下简称《意见》),明确提出到2025年,生态环境分区管控制度基本建立,全域覆盖、精准科学的生态环境分区管控体系初步形成。
2024-03-26 03:20
眼下正值春耕备耕的关键阶段,突如其来的天气变化,是否会对春耕、农作物造成影响?
2024-03-26 10:16
3月24日是世界防治结核病日。南开大学饶子和院士团队与上海科技大学免疫化学研究所张璐研究员团队合作,首次揭示了抗结核新靶标Rv3806c的冷冻电镜三维结构。
2024-03-26 10:16
25日,中国海油发布消息,我国在渤海超5000米的地层钻探发现一口高产油气井,测试日产油气当量近1400立方米,创造了我国海上深层油气探井日产最高纪录。
2024-03-26 10:15
“绝对安全”的通信是千百年来人类的梦想之一,从摩斯电码到电报、传真,从移动电话到网络通信,通信技术的发展同时带来了各类安全隐患,与通信安全相关的技术一直是科技界、产业界的重点攻关方向。
2024-03-25 10:47
记者从中国科学院近代物理研究所获悉,该所研制的中国超重元素研究加速器装置(CAFE2)取得重大突破,成功实现了14.8粒子微安流强、224兆电子伏能量的束流在靶稳定运行,创造了国际同类装置运行束流参数的最高流强纪录。
2024-03-25 10:07
加载更多