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橘小实蝇最完整基因组图谱发布

来源:光明日报2025-12-15 09:50

   光明日报北京12月14日电(记者杨舒)橘小实蝇是一种绿豆大小的农业害虫。别看它是个小不点,却号称“果蔬杀手”,由于其生存、繁殖力强,如何防治一直是个难题。近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)王桂荣课题组联合崔鹏课题组,成功构建了迄今为止最完整的橘小实蝇基因组图谱,为科学家研发基于基因组手段的绿色防控技术提供了新思路,也证明小昆虫能够迈入端粒到端粒的基因组时代。相关论文日前发表于国际学术期刊《自然·通讯》。

  中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员王桂荣介绍,与传统农药相比,针对害虫的绿色防控技术具有更大优势,而破译害虫的基因密码则是获胜的关键所在。高质量的基因组图谱如同一张地图,可以为开发新的绿色防治手段、靶标的精准发现与定位提供关键指引。

  但想“看清”橘小实蝇的基因组可不是一件容易的事。“这种害虫的体长仅有8毫米,是典型的小个体农业害虫,这使得我们从单个橘小实蝇中仅能提取1微克DNA含量,无法达到‘传统测序建库至少需要5微克DNA’的要求。另一方面,橘小实蝇的基因组高度复杂,也成为绘制高质量图谱的难点。”王桂荣说。

  理想情况下,图谱上从染色体一端的端粒到另一端的端粒应该连续完整。由此,研究团队提出一种新的组装策略——以单个体雄虫的测序数据作为基本骨架,整合群体测序数据,利用不同的测序技术相互补充,最终成功组装出中心粒和端粒区域较为完整并包含性染色体、端粒到端粒的基因组。

  与其他橘小实蝇基因组参考版本相比,新的基因组“地图”首次实现从端粒到端粒的无缺口完整覆盖,填补了以往基因组中高度重复的复杂区域留下的空白。研究团队还进一步解析中心粒、性染色体等高重复结构区域,挖掘出Y染色体特异性基因和气味受体等潜在的绿色防控技术靶标,为害虫绿色防控技术的研发与优化提供了高质量参考基因组资源。

[ 责编:田新宇 ]
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