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中国科学报讯 6年前,2018年11月,科学家发起了一项雄心勃勃的计划——地球生物基因组计划(EBP),对大约167万种植物、动物、真菌和其他微生物的基因组进行测序。这项计划起初预计耗资47亿美元、耗时10年。相关负责人认为,拥有诸多完整的DNA序列将阐明生命进化过程,有助于保护环境、改善农业,甚至有利于人类健康。
目前来看,EBP筹集的资金还远远不够,并且进程比原计划落后了几年。正如组织者在近日一次会议上表示的那样,迄今EBP的全球合作伙伴对1060个真核家族的3000个物种进行了基因组测序,并有望在2026年达到1万个物种——这是EBP第一阶段的目标。
“在过去两年里,我们完成测序的基因组数量翻了一番。”EBP组织者之一、美国亚利桑那州立大学的基因组学家Harris Lewin说。
Lewin介绍,到目前为止,来自六大洲28个国家的科学家参与了EBP。对于EBP第二阶段的15万个物种,科学家希望产生非常详细的参考基因组,而不是最初设想的基因组草图。
目前,与EBP相关的测序工作每周大约能产生20个详细的真核生物基因组。为了赶上2026年第一阶段的最后期限,EBP的首要目标是在更多地方发展基因组学的测序能力。
然而,偏远贫困地区的动植物往往是最需要保护和研究的,它们的测序频率却较低。未参与EBP的美国克莱姆森大学的进化生态学家Antonio Baeza说:“EBP几乎没有‘全球南方’的参与。”
EBP设立了两个委员会,以解决伦理、法律、多样性和包容性方面的问题,并帮助在整个世界——而不仅仅是富裕国家,实现数据、技术的公平分配。
第一阶段工作预计花费2.65亿美元,不到最初预计的一半。EBP负责人希望到2032年实现167万个物种的测序目标。由于目前DNA测序速度更快、成本更低、准确性更高,实现这一目标所需的费用将比之前预计的少数亿美元。
EBP仍然需要数十亿美元,而要对所有真核生物进行测序,显然面临着更多挑战。但是研究人员认为,即使EBP只破译了预期基因组的1%,“也能为增进人们对生物多样性和生态系统的理解作出重大贡献”。 (文乐乐)
《中国科学报》 (2024-11-06 第1版 要闻)