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光明网讯 6月20日,记者从南京农业大学获悉,该校万建民院士团队在水稻抽穗期的调控上取得重要进展,相关成果于6月19日在《自然·通讯》(Nature Communications)上在线发表。
水稻抽穗期是决定品种地区和季节适应性的关键性状,影响水稻的产量和品质。不同地区、不同季节的光照和温度不同,水稻的“作息时间”也得跟着调整。所以,找到调控抽穗期的基因,就好比掌握了水稻生长的“遥控器”,对培育高产、优质、适应性强的水稻品种至关重要。
水稻是典型的“短日照爱好者”,它的抽穗时间,受光信号和体内“生物钟”的双重控制。但光信号是如何“告诉”水稻体内的“生物钟”该调整时间的,一直是困扰科学家的谜题。
此次研究中,科学家克隆到一个在长日照条件下特异性调控水稻抽穗的基因Early Flowering at Long Day 1 (ELD1)。它编码的 CCHC-type 锌指蛋白专门负责“组装”和“修理”基因。有趣的是,这个基因很特别:如果它完全“罢工”,水稻胚胎根本长不大;但只要对它的某个氨基酸“微调”一下,水稻就能早早抽穗,而且不会影响其他生长指标。
a-b:ELD1在长日照条件下抑制水稻抽穗;c:ELD1与剪接体核心组分互作;d-e:ELD1调控OsCCA1可变剪接;f:ELD1与OsCCA1,Hd1遗传关系验证;g:ELD1调控水稻抽穗期的模式图
研究发现,ELD1可与OsNKAP(哺乳动物NF-κB activating protein同源物)及多个核心mRNA剪接因子互作。全长转录组测序分析发现,ELD1在全基因组范围内调控上千个基因的可变剪接,特别是在生物钟核心基因 OsCCA1 上介导多个位点的剪接事件。分子与遗传分析表明,ELD1主要通过 OsCCA1-Hd1通路影响水稻抽穗期。
进一步研究发现,ELD1还可与光敏色素phyB的活性形式互作,参与红光调控OsCCA1剪接的过程,揭示了光信号通过可变剪接调控生物钟的分子机制。值得一提的是,长读长测序显示OsCCA1具有超过60种剪接异构体,其功能差异和动态调控机制仍有待深入研究。
本研究不仅揭示了光信号调控水稻抽穗期的全新机制,且在分子育种上取得突破。利用碱基编辑技术对ELD1关键氨基酸进行定点突变,在宁粳7号、宁粳4号等优良品种背景下成功培育出早抽穗新种质,为植物发育必需基因在育种中的应用提供了新范式。
据悉,万建民院士团队长期致力于水稻籼粳杂种优势利用研究,近年来在杂种不育、抽穗期和株型调控等方面取得系列重要进展。本研究为解决籼粳杂交F1代超亲迟熟问题提供了重要基因资源和理论支撑,对培育广适性水稻新品种具有重要意义。
南京农业大学博士研究生蔡亮、郝本元为论文的共同第一作者,万建民院士和周时荣教授为共同通讯作者。该研究得到国家自然科学基金、生物育种国家重大科技专项、生物育种钟山实验室及江苏省重点研发计划等项目的资助。(宋雅娟)